Imunoglobulin adalah protein dan umumnya resisten terhadap pencernaan oleh enzim.
Namun, enzim papain dan pepsin membelah molekul imunoglobulin. Fragmen yang dihasilkan oleh papain dan pepsin berguna untuk mempelajari struktur dan fungsi imunoglobulin. Tetapi tempat pembelahan kedua enzim ini berbeda (Gambar 9.5).
Gambar 9.5: Diagram skematik fragmentasi proteolitik imunoglobulin dengan perlakuan singkat dengan enzim papain dan pepsin.
Enzim papain memotong imunoglobulin pada sisi terminal-N dari ikatan disulfida rantai berat antar dan menghasilkan tiga fragmen (dua fragmen Fab dan satu fragmen Fc). Enzim pepsin membelah imunoglobulin di daerah C-terminal dan menghasilkan satu fragmen besar (yang mengandung dua daerah Fab) yang disebut F (ab’) 2 . Rantai berat yang tersisa di sisi terminal-C dicerna menjadi beberapa peptida kecil
1. Enzim Papain:
Enzim papain membelah daerah engsel pada sisi N-terminal dari disulfida rantai antar-berat dan ini menghasilkan pembentukan tiga fragmen. (Dua fragmen berisi daerah variabel dan satu fragmen berisi daerah CH 2 dan CH 3). Dua fragmen yang berisi wilayah variabel disebut; Fragmen Fab, (yaitu pengikatan antigen fragmen) karena mereka memiliki situs pengikatan antigen.
Fragmen ketiga terdiri dari bagian terminal karboksil dari kedua rantai berat yang disatukan oleh disulfida. Umumnya struktur fragmen ketiga identik untuk banyak molekul imunoglobulin yang berbeda.
Oleh karena itu, fragmen jenis ini dapat dikristalisasi meskipun terdiri dari banyak imunoglobulin yang berbeda. Jadi, fragmen ini disebut fragmen yang dapat dikristalisasi atau fragmen Fc. Sebagian besar sifat biologis sekunder dari imunoglobulin bergantung pada urutan di wilayah Fc. Juga ini adalah wilayah yang dikenali oleh reseptor Fc pada banyak tipe sel.
2. Enzim Pepsin:
Enzim pepsin membelah imunoglobulin pada sisi terminal karboksi daerah engsel menghasilkan satu fragmen besar yang disebut F(ab’) 2 . F (ab’) 2 memiliki dua fragmen Fab yang dihubungkan oleh ikatan disulfida. Wilayah Fc didegradasi secara ekstensif oleh pepsin, dan biasanya tidak ada fragmen Fc utuh yang tersisa setelah pencernaan pepsin.
